تم انشاء قسم التشريح و الاجنة بالكلية في عام 1969م مع بداية انشاء الكلية.

وقد قام القسم بأداء رسالته العلمية علي اكمل وجه وذلك بالتدريس لطلاب الفرقتين الاولي والثانية بالكلية. هذا بالاضافة الي التدريس لطلاب الدراسات العليا بالكلية سواء المعيدين بالقسم او المعيدين والمدرسين المساعدين بالاقسام الاخري بالكلية علاوة عن الطلاب المسجلين لدراجات الماجستير والدكتوراة من خارج نطاق الكلية.

أما عن ادارة القسم داخليا فقد قام بها أساتذة اجلاء علي اكمل وجه مما ساعد كثيرا علي نجاح العملية التعليمية بصورة منتظمة و مشرفة للقسم والكلية في الفترة من 1969وحتي اليوم 26/2/2018 وهؤلاء الاساتذة الذين قاموا برئاسة القسم خلال هذه الفترة بصورة متتابعة هم كما يلي

1- ا0د/محمد عبد العزيز الحاجري في الفترة من25/8/1975 الي 27/6/1980

2- ا0د/عبد المنعم مبارك محمد في الفترة من28/6/1980 الي 27/6/1986

3- ا0د/محمد احمد علي في الفترة من24/4/1988 الي 2/4/1994

4- ا0د/منصور سيداحمدعويس في الفترة من24/4/1994 الي 12/11/1998

5- ا0د/علي الدين عبد الباسط علي في الفترة من22/11/1998 الي 21/11/2004

6- ا.د/ سعيد عمار في الفتره من 27/11/2004 الي 31/7/2007

7- ا.د/ حسن أنيس في الفتره من 6/8/2007 الي 31/7/2009

8- ا.د/ ابراهيم خضر في الفتره من 1/8/2009 الي 31/7/2010

9- ا.د/ عاطف عبدالعزيز في الفتره من 1/8/2010 الي 23/9/2012

10- ا.د/ صلاح الدين عبدالعزيز في الفتره من 23/9/2012

11- ا.د/ مرفت محمد حسن قنصوه في الفتره من 1/8/2014 حتي الان

وخلال جميع الفترات المتعددة الانفة الذكر من رئاسة القسم للاساتذة المذكورين فقد دأب القسم علي تطوير العملية التعليمية به الي الافضل وذلك تمشيا مع التطور العلمي والجودة في الاداء والذي تشهده العملية التعليمية علي مستوي الجمهورية.

و القسم بدوره (كأحد اكبر الاقسام الموجودة بالكلية) يشارك بجد واقتدار في جميع اعمال الجودة و السيكاب بالكلية علاوة علي المشاريع العلمية الممتازة التي يتبناها القسم (كمشروع البلستكة) الذي يثري به القسم العملية التعليمية داخل نطاق الكلية و الجدامعة ناهيك عن استفادة بعض الكليات بالجامعات الاخري بالجمهورية.

عدد اعضاء هيئة التدريس بالقسم 19ومعاونيه 3